1、人工清洗。将水箱拆卸下来后用刮、铲清除水锈，再用水清洗一遍水箱，但是这种方法容易对水箱造成损害，力度过大、次数过多会使水箱漏水。
2、冷却系统清洁剂清洗。可以用冷却系统清洁剂进行清洗，先将散热器底部的排放塞打开，让冷却液流入桶中，切勿随意排放对环境造成污染，随后关闭排放塞，向散热器中注水后打开加热器控制阀，加入冷却系统清洗剂后空转发动机30分钟，关闭发动机冷却五分钟后将废水排出，再加水冲洗一遍后重新注入冷却液即可。
3、水垢清洗剂清理。需要将水箱拆卸下来，将水垢清洗剂倒入水箱进行清洗。这种方法容易造成水箱老化，缩短其使用寿命。
水箱是汽车的冷却液散热器，发动机上的水泵把热水打入上水室，经过散热管带冷却后进入下水室再进入发动机循环。
如果水箱生锈，长时间不清理会限制冷却液在冷却系统中的流动，从而无法达到有效的降温效果，造成发动机过热甚至损坏，同时冷却液氧化后也会生成酸性物质，长时间不清理水锈也会导致酸性物质腐蚀水箱内的零件，造成水箱漏水。
热水冲洗：将水箱中的水放空，然后用热水反复冲洗水箱内部，直到水垢基本清除。
白醋除垢：将白醋与水按1:3的比例混合，然后将混合物倒入水箱中，放置12小时，最后再用清水冲洗干净即可。
小苏打除垢：将小苏打与水按1:3的比例混合，然后将混合物倒入水箱中，放置12小时，最后再用清水冲洗干净即可。
柠檬酸除垢：将柠檬酸与水按1:3的比例混合，然后将混合物倒入水箱中，放置12小时，最后再用清水冲洗干净即可。
除垢剂除垢：将除垢剂按照说明书上的比例稀释，然后将稀释后的除垢剂倒入水箱中，放置12小时，最后再用清水冲洗干净即可。
