常熟汽车南站和常熟南站是两个不同的交通枢纽，它们有以下区别：
功能不同：常熟汽车南站是一个汽车客运站，主要负责长途汽车的发车和到达；而常熟南站是一个火车站，主要负责火车的进出站和旅客的乘降。
运输方式不同：常熟汽车南站主要提供汽车运输服务，而常熟南站主要提供铁路运输服务。
车辆类型不同：常熟汽车南站主要停靠长途客车，而常熟南站主要停靠火车。
总之，常熟汽车南站和常熟南站在功能、运输方式和服务对象等方面存在明显的区别
两个车站营运的交通工具不一样
汽车南站是常熟市汽车站之一，1995年修建，主要营运线路是通往省外的班线，共有运营车辆86辆，是市里最早运营的汽车站之一。
而常熟南站是高铁站，于2009年兴建而成，距离市中心有3.5公里。
