12306的乘车码，只有在实行刷码乘车的地方，才可以进站乘车。以广深港铁路为例，广深城际铁路全线各站都已支持支付宝扫码乘车。 出行当天就能直接使用支付宝刷码进站，无需到窗口和自动售票机排队购票，也无需提前在网上购票。
旅客刷码进站成功后，将会收到一条短信，告知最近一班火车的车次、座位号。
进站时按照二等座全程费用预扣费，到达目的地后，系统会按照实际产生的票价计费，十分方便。
用户在购票后，车票会对应一个唯一的二维码，方便用户进站，登车使用。但，目前各个火车站无论硬件还是软件的配置程度不同，所以造成有的车站二维码可以使用，有的不能使用。一般来说，越大的火车站越能用，越小的火车站不能用的可能性越大。
