这是因为它有适应水中环境的特殊结构，即体内的通气孔特别多。通气孔既可流通空气，又能增加浮力。
藕生长在几乎不含氧气的淤泥中，它的呼吸道通过藕体内的孔眼(通气孔)交换气体。
这些孔眼又与荷叶挺出水面的部分彼此贯通，形成一个输送气体的系统，使从叶面气孔吸收来的氧气可以向下运输到莲的地下部分，供其生长的需要。
当藕体内的水分过多时，它还可以从叶片中央的排水小孔渗出细小的水珠，这些水珠会在叶面上滚来滚去，犹如碧盘托珠。
莲有利于适应水中环境的特点：莲的叶子进化出了适应水生活的本领，水位高它的叶柄就拉长，不至于淹死。生物对环境的适应是普遍的，但这种适应性是相对的，不是绝对的，研究发现莲藕、叶柄和叶片中均有气腔孔，且这引起气腔孔彼此贯通，使叶片气孔吸收来的氧气可以向下运输到莲的地下部分，供其呼吸作用的需要，莲体内具有适应水中环境的特征，是环境生长期对莲进行自然选择的结果。
