南航旗下的航空公司有：
南航目前有地区分公司18个，飞机526架；控、参股子公司包括：厦门航空（146架）、重庆航空（17架）、河北航空（20架，厦航子公司）、江西航空（5架，厦航子公司）。共计714架。
南航集团拥有中国南方航空股份有限公司、南航贸易公司、南航财务公司、南航客货公司、南航传媒股份公司、南航建发公司、珠海摩天宇、南航物业公司8家成员企业。
南航设有14家分公司（新疆、北方、北京、深圳、海南、黑龙江、吉林、大连、河南、湖北、湖南、广西、台湾、珠海直升机）和厦门航空、汕头航空、贵州航空、珠海航空、重庆航空等5家附属公司。
