施工单位应编制专项施工方案的工程包括但不限于以下几个方面：
首先，具有一定风险、复杂性、特殊性的工程需要编制专项施工方案，如高层建筑、大桥、隧道等；
其次，需要特殊施工技术或特殊设备的工程也需要编制专项施工方案，如沉管隧道、爆破拆除等；此外，需要进行特殊施工措施的工程也需要编制专项施工方案，如地下水位较高的地下工程、脆弱地层的挖掘等。编制专项施工方案可以帮助施工单位系统地分析和解决工程中的技术难题和风险问题，确保工程施工的顺利进行。
施工单位应编制专项施工方案的工程包括：
1. 地下暗挖工程；
2. 深度超过16米或地质条件复杂的基坑、沟槽；
3. 高大模板工程；
4. 脚手架工程；
5. 施工临时用电工程；
6. 起重机械安装拆卸工程；
7. 拆除、爆破工程；
8. 国务院建设行政主管部门或者其他有关部门规定的其他危险性较大的工程。
