1、所属植物不同：辣根是西洋山葵根部制作出来的调料，一般生活中常见的绿芥末就是辣根制作出来的；芥末又称西洋山芋菜、芥辣粉，是芥菜的成熟种子碾磨成的一种辣味调料，一般分黄芥末和绿芥末两种，但真正的只有黄芥末，因为绿芥末是辣根制作而来的，就算市场上有，也大多是经过食用色素染过的。
2、产地不同：辣根原产自欧洲南部和土耳其，在我国种植的少，目前在上海、青岛、黑龙江、辽宁等地有一定的种植；芥末产自中国，在我国东北地区比较常见。
3、价格不同：辣根价格比较便宜，目前市场上的山葵酱(青芥辣)和山葵粉大多因为成本的原因采用辣根制作，它的售价仅为山葵产品价格的五分之一；芥末价格就稍贵些，且大多是经过食用色素染过的。
4、味道不同：辣根吃起来温和，没有芥末刺激；芥末味道辛辣，有一点点苦味，一般很难接受。
5、吃法不同：辣根一般用于烤肉类；芥末一般用来拌菜，比如芥末白菜、芥末白菜和芥末鸡丝等。
辣根和芥末区别是：定义不同、味道不同、产地和出现时间以及初始作用不同
1、定义不同：
市面上较为便宜的“绿芥末”，大多是用辣根制成的。它是十字花科马萝卜属。不过，辣根的根部是浅黄白色，加入了绿色色素才变成市面上的样子。辣根的英文名叫Horseradish，直译为“马萝卜”。
传统意义上的芥末，其实是指用芥菜籽研磨而成的调味品，它是世界上最普及，也是历史最悠久的香料之一。
2、味道不同：
辣根含有辛辣的异硫氰酸酯类化合物，有杀菌功效。
完整的芥菜籽本身是不辣的。芥菜籽粉碎并加水之后，其中含有的芥子硫苷和芥子酶才会水解反应，生成辛辣的异硫氰酸酯。
3、产地和出现时间以及初始作用不同：
辣根原产于中欧地区，早期只是药用植物，用来治疗咳嗽、风湿等病症。芥菜籽在石器时代已经出现，古代的欧洲人一般把芥菜籽视作药物而非食物，用来治疗牙疼等一系列疾病。
参考资料来源：
央视网-食材揭秘：辣根和芥末是同一种东西么？
央视网-让我们泪流满面的芥末，真身到底是什么
