南京大学王牌专业是该校的国家级特色专业：如地质学、水文与水资源工程(地球科学与工程学院)
软件工程(软件学院)
物理学(物理学院)
大气科学(大气科学学院)
化学(化学化工学院)
生物科学(生命科学学院)
环境科学(环境学院)
临床医学(医学院)
汉语言文学(文学院)
历史学(历史学系)
哲学(哲学系)
新闻学(新闻传播学院)
经济学(商学院)
国际经济与贸易(商学院)
行政管理(政府管理学院)
数学与应用数学(数学系)
天文学(天文与空间科学学院)
英国语言文学、法语(外国语学院)。
上述专业为南大的王牌专业，就业率极高。
