酸菜鱼一般选用刺杀娇嫩的淡水鱼类，如鲤鱼、草鱼、黑鱼、青鱼、鲈鱼、龙利鱼等，都适合用来做酸菜鱼。虽然鲤鱼的鱼刺少，但其土腥味较重，做鱼时要对除腥引起足够重视。
草鱼：草鱼是典型的草食性鱼类，栖息于平原地区的江河湖泊，一般喜居于水的中下层和近岸多水草区域。
黑鱼：黑鱼，是乌鳢的俗称。乌鳢属鲈形目、鳢科，是鳢科鱼类中分布最广、产量更大的种类，又名乌鱼、生鱼、财鱼、蛇鱼、火头鱼、黑鳢头等。
青鱼：青鱼通常栖息在水的中下层，生性不活泼。其主要的食物来源为螺蛳、蚌、蚬、蛤等，偶尔也捕食虾和昆虫幼虫
草鱼和鲢鱼都可以做酸菜鱼，和水煮鱼，都要切成鱼块和片才嫩。
