水利水电工程施工总承包三级资质和水利水电工程乙级资质的区别在于:
结论：两种资质的级别不同，涵盖的管理范围和业务能力不同。
解释原因：水利水电工程施工总承包三级资质是指企业质量、安全、机电等方面都已经达到一定水平，能够进行惯常建设或者修建一些大型工程项目；而水利水电工程乙级资质是指企业建造一些较小的水利水电工程，管道工程、防渗工程周边工程等方面能够达到所需标准。
内容延伸：如果在进行水利水电工程建设时，需要考虑到工程规模、项目难度和投资额度等不同因素，选择适合的资质等级进行申请，才能够更好地开展工程建设。
水利水电工程施工总承包三级资质是指企业具备承担国内外水利水电工程施工总承包业务的能力，且注册资金不低于5000万元人民币的资质等级。
而水利水电工程乙级资质是指企业具备承担一般水利水电工程建设业务的能力，且注册资金不低于1000万元人民币的资质等级。
简单来说，三级资质适用范围更广，可以承接更大规模、更复杂的项目，要求相对较高；而乙级资质则适用范围相对较窄，只能承接一般性的水利水电工程建设项目。
