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化肥和有机肥都属于肥料，但其区别就有明显不同，化肥是化学肥料的简称，主要是大、中、微量元素经过物理或者化学反应制造成的肥料，而有机肥是利用动物粪便或者植物秸秆、工厂下脚料生产的含有有机质的物质制造成的肥料，其间的大、中、微量元素很少。对于农作物来说，化肥和有机肥的区别就更大了，两者可以协同配合，来促进作物的生长。
有机肥料是天然有机质经微生物分解或发酵而成的一类肥料。中国又称农家肥。不是化肥。
有机肥分为纯粹的有机肥和有机复混肥。
纯粹的有机肥多是动物粪便，植物枝叶，作物植株，食物残渣等经过腐熟，发酵而成的农家肥，沤肥，堆肥。量少，恶臭，只适合于自家使用，不适合大规模应用。现在也有一些小型工厂利用鸡场，鸭场，养猪场等的粪便做成柱状有机肥的，不过还是有臭味。
有机复混肥是用泥炭土，腐植酸等高含量有机质的原料加上少量的氮磷钾无机肥掺混造粒而成的粒状或粉状肥料。性质比农家肥要好，而且施肥方便，没有恶臭。适合于大规模，机械化施肥，是农场，蔬菜基地，林场，草场的最爱。
