在效果上，戴隐形眼镜与美瞳有很大的区别，隐形眼镜一般都是透明和浅蓝色的，佩戴后并不会很明显，一般很难发现，只是会显得眼睛稍亮些。隐形眼镜的主要功效就是清晰视觉和矫正视力。
在这一点上，美瞳完全与隐形眼镜不同，美瞳的主要功效是美化瞳孔，它有着多种颜色和花纹，镜片大小也不一，效果各有不同，不仅可以改变眼睛颜色、大小，还能从视觉上改变眼睛的美观度，达到提升颜值的目的，很多人选择戴美瞳，也都是因为它的美化功效。
在佩戴操作上，隐形眼镜与美瞳并没有太大区别，基本一致，使用前的清洁双手，佩戴时的一些基本操作流程都一样，唯一的不同就是镜片的佩戴时间上，因为美瞳多了一层色素存在，它的透氧性会稍差，所以，佩戴时间上要短于普通隐形眼镜，一般建议6~8小时就需要取下。
在清洗上，美瞳也与隐形眼镜一样，都需要用到专用的护理液清洗、消毒、保存。当然，美瞳不能用双氧水清洗，这一点也有些不同，因为双氧水杀菌效果太强，容易使美瞳的色素层变质，从而引起眼部不适，所以，使用一般护理液清洗美瞳即可。
最显著的差别在于：美瞳有颜色、隐形眼镜没有颜色，并且美瞳对眼睛的投氧性对更差一些。相比较之下，隐形眼镜对眼球的伤害会更小一些，美瞳上的颜色可能会对眼睛造成一定的刺激。
