1.商家不同。京东自营可以理解为消费者是跟京东在做买卖，采用B2C的销售模式，即商家直接到客户的模式，采购产品的发票是由京东公司开具；非自营店，是京东提供平台给厂商，厂商与消费者通过京东提供的平台进行交易，商家给消费者开具的发票就不是京东的了，另外，商家还需要给京东缴纳一定的平台使用费。
2.物流和发货不同。京东自营是由京东仓库发货（京东目前在全国有八个京东仓库）。简单理解就是京东用批发价向商家拿货，先放到京东仓库中，然后在平台进行销售。客户下单
京东自营是指京东商城直接与品牌商或供应商合作，自己直接进货并进行销售的模式，也称为“自营模式”或“自营业务”。
京东非自营则是指京东商城上的商家或供应商通过京东平台进行销售的模式，也称为“第三方模式”或“第三方业务”。
这两种模式之间的主要区别在于：京东自营模式中，京东商城直接从品牌商或供应商处采购商品并进行销售，自己承担库存风险和售后服务等责任；而京东非自营模式中，京东商城只是提供了一个销售平台，由商家或供应商自行采购、存储和发货，并承担售后服务等责任。
对于消费者来说，京东自营和非自营的区别在于：京东自营商品由京东直接采购并销售，品质相对更有保障，同时京东还提供更加全面的售后服务；而京东非自营商品则由不同的商家或供应商提供，商品质量和售后服务等方面的差异可能较大。
需要注意的是，京东自营商品并不代表一定比京东非自营商品价格更高，而是由于京东自营掌握了商品的采购渠道和售后服务，能够更好地控制成本和提高效率，因此可能在一些商品价格上更具有竞争力。
