1、申请对象不同。廉租住房的申请对象为本市城镇低收入住房困难家庭，而公租房的申请对象可以不受区域和户籍限制。
2、收入限制标准不同。主城区申请廉租住房的收入限制标准为家庭人均月收入低于450元。而申请公租房的收入限制标准为单身人士月收入不高于2000元，家庭月收入不高于3000元。
3、交纳的租金不同。廉租房月租金标准约为每平方米0.8到1.2元。而公租房的租金标准按照贷款利息、维护费等因素确定，不超过同类地段、同等品质房屋租金的60％，并实行动态调整。
保障房是一个概括性总称呼，它包括政府周转房、经济适用房、安居型商品房（安居房）、公共租赁住房（公租房）、廉租房等具有保障性质的住房。保障房主要是各级政府为解决无房或者低收入人群住房需求而提供的住房，申请保障房都附带一定条件的。廉租房是保障房的一种形式，申请人主要是城市低收入人群。
