区别在于所有者概念的内涵与外延。全民所有制，是国家所有的经济资源所有权归全国公民，并按国家一定的法律法规制度安排，由专门机构行使经营、管理、权益分配等事务。
集体所有制虽然也是公有制的一种实现形式，但这是特定组织、团体、村社范围之内的经济资源所有权的一种制度安排，它与私有制是完全相对的一种经济制度。
作为个体的自然人，不可逾越集体依法制定的章程、制度去支配集体所有的任何经济资源及其相关事项。这是两种所有制的根本区别。
两者的区别就在于生产关系的所有制的不一样。全民所有制：是国家所有制，他的生产资料和生产价值即所得归国家所有，这些单位或企业也是国营单位和企业，比如：国营农场；集体所有制：是生产资料和生产所得归集体所有和根据国家政策可以自主分配，比如：过去的农村生产队。
