《崖上的波妞》讲述了一个稍微有点感人的故事，主要围绕着波妞与宗介之间的友谊和爱情展开。
在片中，五岁的宗介与妈妈理莎住在一个靠海小村庄的山崖上。一天，宗介在山崖下的海滩上捡到了一个被困在玻璃瓶里的波妞，他救出波妞并将她养在一个绿色的塑胶水桶里。波妞是魔法师藤本的女儿，她决心变成人类小女孩回到宗介的身边，于是离家出走，并倒掉了父亲最珍藏的“生命之水”。这个举动造成了巨大的动荡，海平面开始快速上升，波妞的妹妹们变成了鱼形的巨大海浪并吞噬了宗介住的小镇。
在经历了一系列冒险和挑战后，波妞成功找到了宗介，两个小朋友之间深厚的友谊和纯真的爱情最终也得到了魔法师的认可。
该片讲述了深海里一心想变成人类的人鱼波妞与人类男孩宗介之间的故事。剧情简介五岁的宗介与妈妈理莎，住在一个靠海小村庄的山崖上。身为船长的爸爸长年出海，留下宗介与妈妈相依为命。因此五岁的宗介从小就超龄的懂事，也知道自己必须担起家中的责任，要代替父亲照顾妈妈。一天当他在山崖下岩石遍布的海滩上玩耍，他拾回了一只头困在玻璃瓶里的人鱼波妞，宗介救出波妞并且将她养在一个绿色的塑胶水桶里。波妞与宗介相互着迷。
