强。冬瓜为直根系，属深根性植物，根系强大，根系由主根、侧根须根和不定根组成，主根发达，侧根和细根也都发达。冬瓜的主根可深入土层1~1.5米，侧根的幅度为1.5~2米，侧根及须根主要分布在15~25厘米的耕作层内。冬瓜耐旱性强，既耐肥水，又耐瘠薄，生长势强。冬瓜的根系有很强的好氧性，若土壤中氧气不足时，则根毛少，吸收能力下降，植株的生长会受到抑制，生长势弱，易发生病害，严重时会造成死秧。因此，栽培过程中，要注意保持土壤疏松，不积水。
冬瓜根茎处易产生不定根，栽培中进行培土或压蔓，可促使不定根发生，以扩大吸收面积。
