有区别，区别在于，本田CR-V的5AT和CVT变速箱在多个方面存在明显区别。
首先，5AT（自动变速器）主要是利用液力变扭器配合传统机械齿轮箱实现换挡功能，技术成熟，操作方便，应用广泛。这种变速箱的可靠性、稳定性非常高，给人一种有操作感、驾驶乐趣较好的体验。然而，5AT变速箱的油耗相对较高，因为通过油介质实现动力传递的方式效率较低，部分动能会被浪费。
而CVT（无极变速器）则采用传动带和工作直径可变的主、从动轮相配合传递动力，没有齿轮，因此在换挡时的时间会更短，基本上没有什么顿挫感，驾驶感受平顺。CVT变速箱的燃油经济性能较高，制造成本和维修成本相对较低，主要用于小排量汽车。
综上所述，本田CR-V的5AT和CVT变速箱在换挡方式、驾驶感受、油耗和制造成本等方面存在明显区别。选择哪种变速箱取决于个人的驾驶需求和偏好。
