节节草植株直立,叶片二裂,营养茎在孢子茎枯黄后生出。叶退化,其下部联合成鞘,鞘齿披针形,黑色膜质。分枝轮生。孢子茎于早春先出,紫褐色,肉质。孢子六角形,盾状着生,螺旋形排列。中小型植物。根茎直立,横走或斜升,黑棕色,节和根疏生黄棕色长毛或光滑无毛。