鱼腥草平铺在篮子里撒上清水能保存三至五天，盆子里盛上清水放在盆子里保存的时间更长，用清水洗干净后沥干放进冰箱里低温冷藏能保证根的新鲜，把鱼腥草直接晒干或者用微波炉加热烘干水分之后用袋子装起来自然储存，不用密封。
保鲜方法一：鱼腥草根是鱼腥草的根部，相当于整个植物体的生命力来源，因此保鲜鱼腥草的方法之一是用泥土保存。假如家里或附近有泥土的话，可以直接取适量泥土放入花盆中，将鱼腥草根直接埋入，此时需要注意土壤湿度要高，温度要低，因此可以将花盆移到室内，添加适量水分。
这种保鲜方法最原始也最有效，并且不会破坏鱼腥草的结构，充分使鱼腥草根保持它的特性。不过令人觉得麻烦的是，这种方法保鲜的鱼腥草根清洗的时候会很耗时，如果不把泥土洗干净，会很影响食用。
方法二：生活中对于食物最普遍的保鲜方法就是用冰箱冷冻。鱼腥草根也适用于这一种方法。冰箱是大部分家庭中都有的家电之一，在夏季的闷热气候下，冰箱可以发挥其很大的用处，包括制作甜筒和保鲜食物。鱼腥草根用冰箱保鲜的方法是将鱼腥草放入碟中，然后用保鲜膜封住鱼腥草，此举是为了防止鱼腥草根的水分流失。
方法三：太阳保鲜法。这种方法是相对于鱼腥草根晒干之后而言的。晒干的鱼腥草根遇潮湿天气会变质，因此也需要保鲜。保鲜方法就是晒太阳，太阳有杀菌的作用，可以使鱼腥草根避免变质。
