在不知道怀孕的情况下做了两次核磁共振,这种情况可能会对宝宝有一定的影响,建议在怀孕期间定期去医院进行产检,做好唐筛检查和四维彩超检查,判断有无出现发育异常问题,如果有宝宝畸形的情况存在,最好及时流产,以免对身体产生伤害。