1. 种子品质不佳。如果种子存储不当或品质受损，就会影响催芽和生长。比较常见的种子质量问题就是老化和霉变。
2. 黄化壮汁不到位。种子催芽阶段需要大量能量供应，其中黄化壮汁就是重要的能量供应源。因此，如果黄化壮汁不到位，也会导致催芽不成功。
3. 水温过高。如果水温过高，就会烫死种子和嫩芽，这样就无法顺利催芽长根。
4. 水温过低。水温过低时，嫩芽生长缓慢，长根不强，容易腐烂。如果过低还会导致胚乳吸收不足，影响到幼苗的成长和发育。
1、水分过多引起。水稻育秧时，需要注意水量。移栽之后，田间水分过多或水层过深时，不仅土壤温度偏低，不利于根系呼吸生长，不利于水稻生根，同时也会影响地上部分生长。
2、温度过低影响。水稻生长要求日降温不宜过低，如果播种较早，或出苗、栽插后遭遇持续低温影响时，会影响水稻生长及其生根。
3、药害或肥害影响。水稻育秧或种植时施肥或施药不当，尤其使用不合适的肥料，或除草剂过量等影响，轻者影响水稻生根，重者出现烧苗死苗等。
