1、 由不同的对象发出。
公务护照：公务护照主要签发给各级政府部门副处级以上官员、驻外外交代表机构、领事机构、联合国组织和专门机构工作人员及其随行配偶、未成年子等。 普通护照：一般发给国家派出的研究生、留学生、访问学者和工程技术人员。
2、 护照样式不同。
公务护照：护照封面为黑色或绿色镶金字，中央为中华人民共和国国徽，国徽上方印有中华人民共和国，下方印有公务护照。 普通护照：护照封面为黑色或绿色镶金字，中央为中华人民共和国国徽，国徽上方印有中华人民共和国字样，下方印有公务普通护照。
3、 发行单位不一样。
公务护照：中华人民共和国外交部负责签发。
普通护照：由中华人民共和国外交部或当地外事办公室签发。
公务普通护照的办理方式与因私护照不同。 因私护照拿着身份证就能办理，公务普通护照必须拿着第一次出境的所有对方、己方开具的准备签证材料，在第一次办理签证的时候，用户口本和身份证。
