优点 ：
1.分析可以再设备普通的实验室里进行
2.能够分析大量的样品。因为通过仔细的计划，好几批试样可以同时分析以及为分析做好准备。
3.原始数据能够容易的处理以供在计算机中进一步求值
4.检测极限也从最初的u mol, 级提高到p mol 级
5.氨基酸不用柱前衍生，直接上样进行分析，操作步骤简单，故是迄今氨基酸定性、定量分析中应用最广泛的方法之一。柱后衍生试剂除茚三酮外，还有可用荧光检测的邻苯二甲醛，使检测灵敏度得以提
高，已达5-10 mol
缺点：（1）由于仪器结构复杂，造成价格昂贵；（2）离子交换树脂易压缩，流动相流速的加快不与压力的增加成比例，故测定时间相对较长；（3）氨基酸经离子交换柱分离，在柱后与水合茚三酮衍生剂混合进行反应，势必造成柱后扩散比较大，峰形变宽，分辨率降低；（4）有些柱后衍生剂如邻苯二甲醛虽能用灵敏的荧光检测，但不能与亚氨基反应，故不能检测脯氨酸
