一、科属不同
1、海水石斑鱼：海水石斑鱼是名贵海洋经济鱼种，别称海鸡鱼、鲙鱼、黑猫鱼等，在生物分类学上属于动物界、脊索动物门、硬骨鱼纲、鲈形目、鮨科、石斑鱼亚科的统称。
2、淡水石斑鱼：淡水石斑鱼学名花身副丽鱼，别称美洲虎慈鲷、马拉丽体鱼等，在生物学分类上属于动物界、脊索动物门、硬骨鱼纲、鲈形目、慈鲷科、副丽鱼属淡水鱼类。
二、形态特征
1、海水石斑鱼：海水石斑鱼体呈椭圆形或长椭圆形，侧扁，头长大于体高，口大，两颌齿内行齿倾倒，体被小栉鳞，侧线达尾鳍基部，背鳍鳍棘部强大，臀鳍鳍棘3根，胸鳍位低、圆形，腹鳍位于胸鳍下方，尾鳍圆形、截形或凹型，体色因种类、生长环境等不同而不同。
2、淡水石斑鱼：淡水石斑鱼体呈纺锤型，口上位，躯干两侧各有8条黑纹，垂直黑条纹中央有较黑的色素块，胸鳍淡黄色，腹鳍、背鳍、臀鳍皆有黑色条纹，尾鳍的黑色条纹和身体垂直，除黑白条纹外成鱼体表略带黄色，繁殖期雄鱼体色较黑，雌鱼体色较淡并带有黄色。
三、产地分布
1、海水石斑鱼：海水石斑鱼是海洋鱼类，广泛分布于大西洋、印度洋和太平洋的热带及亚热带海域，全世界有16属163种，我国有11属65种，主要分布在东海、南海和台湾海峡，尤以台湾海峡的澎湖列岛附近海域最丰富。
2、淡水石斑鱼：淡水石斑鱼原产于中美洲，尼加拉瓜、洪都拉斯、哥斯达黎加等地均有分布，1988年引入台湾并广泛养殖于台湾南部地区，1996年广东、江西养殖单位从台湾引入，1999年又引入济南淡水养殖科学研究所。
四、生活习性
1、海水石斑鱼：海水石斑鱼是暖水性鱼类，喜栖息在热带及亚热带沿岸岛屿附近的深海中，一般不成群活动，最适水温22～28℃，适应盐度11～41‰，肉食性，性凶猛，常以突袭方式捕食底栖甲壳类、小型鱼类、头足类等为食。
2、淡水石斑鱼：淡水石斑鱼热带淡水鱼类，可在盐度10‰以下海水中生长，最适水温25～30℃，水温低于20℃时食欲减弱，水温低于15℃时失去平衡甚至死亡，杂食偏肉食性，主要以浮游动物、水生昆虫、小鱼、甲壳类等为食。
淡水石斑鱼和海水石斑鱼的主要区别
一、生活环境不同
1、淡水石斑鱼为热带鱼类，均在淡水中生长，也可在盐度为百分之一以下海水中生长。其适温范围在30度左右，当水温下降至20度时，摄食明显减少，水温下降至15度时身体失去平衡，故冬季期间池水会降至15度以下的地区不适合淡水石斑鱼生长。
2、海水石斑鱼春夏季分布于水深10到30米处，盛夏季节也会在水深2到3米处出现；秋冬季当水温下降时，则游向40～80米较深水域。适温范围为34度左右，最适水温为28度。适盐范围广，可在盐度百分之一以上海域生存。为肉食性凶猛鱼类，以突袭方式捕食底栖甲壳类、各种小型鱼类和头足类。
二、市场价格不同
1、淡水石斑鱼价格
淡水石斑鱼具有生长速度快、耐低氧、产量高、抗病力强、肉质鲜美等优点，目前市价为每公斤70元。不过不同的地方，淡水石斑鱼价格会发生一定的变化，有的地方淡水石斑鱼价格在50-60元之间，如果是死的淡水石斑鱼，价格多在40-50元之间。
2、海水石斑鱼价格
如果是养殖的海水石斑鱼价格在30-40元/斤，而野生的石斑鱼则在80-100元/斤。
