曲霉,乳酸菌和酵母菌。酱油的发酵分两阶段进行，其中包含了三种类型微生物的生化作用，这些微生物有曲霉菌、乳酸菌和酵母菌。
第一步：用酱油曲霉和米曲霉接种到煮过的大豆和烘焙压裂的小麦混合物上。
第二步：当霉菌生长到一定程度，混合物上布满了菌丝时，放入18%的盐水中进行发酵。
米曲霉菌。酱油是用米曲霉菌制作成的。因为酱油用的原料是植物性蛋白质和淀粉质,植物性蛋白质便取自大豆榨油后的豆饼。
由米曲霉产生的酶系将豆类中的蛋白质、淀粉和脂肪水解成氨基酸、糖等,再经耐盐乳酸菌和耐盐酵母菌发酵生成酒精、有机酸和酯,便成为酱油。
