重庆市目前的重点大学（除陆军军医大学）有：
1.重庆大学，国家“双一流”A类世界一流大学、“211工程”和“985工程”首批重点建设的高水平研究型综合性大学。
2.西南大学，国家“211工程” 、“985工程优势学科创新平台”，教育部、农业部与重庆市共建的综合性全国重点大学。
3.西南政法大学，改革开放后首批全国重点大学，学校以法学为主，经济学、文学、管理学、哲学、工学等多学科协调发展，被誉为新中国法学教育的“西南联大”。
4.重庆医科大学，创建于1956年，学校是国务院学位委员会批准的首批具有博士和硕士学位授予权的单位。
5.重庆邮电大学，是国家“2011计划”核心协同高校、中国政府奖学金院校、国家布点设立并重点建设的四所邮电高校之一。6.重庆交通大学，是一所交通特色鲜明、以工为主的多科性大学，是交通运输部与重庆市共建高校，入选国家“中西部高校基础能力建设工程”、“卓越工程师教育培养计划”。
7.重庆师范大学，入选国家首批卓越农林人才教育培养计划和卓越教师培养计划，“马云乡村师范生计划”首批合作院校。
8.重庆工商大学，入选“中西部高校基础能力建设工程”、卓越农林人才教育培养计划，是一所经济学、管理学、文学、工学、法学、理学等学科协调发展的、具有鲜明财经特色的多科性大学。
9.重庆理工大学，前身是创办于1940年的国民政府兵工署第11技工学校；1999年，更名为重庆工学院；2009年，经教育部批准更名为重庆理工大学。
重庆的重点大学只有五所，分别是：
重庆大学；
西南大学；
重庆医科大学；
西南政法大学；
重庆邮电大学。
重庆大学
重庆大学是中共中央直管、教育部直属的`副部级全国重点大学，由教育部和重庆市共同建设。
1929年刘湘创办重庆大学；1935年批准为省立大学；抗战期间和西迁的中央大学合作办学。1942年更名为国立重庆大学，成为有文、理、工、商、法、医6个学院的国立综合性大学，1960年成为全国重点大学。
西南大学
西南大学是中华人民共和国教育部直属高校，由教育部、农业部与重庆市人民政府共建，是“双一流”世界一流学科建设高校，位列国家211工程、985工程优势学科创新平台。
西南大学由原教育部直属西南师范大学与原农业部直属西南农业大学于2005年合并而成，溯源于1906年建立的川东师范学堂。1936年更名为四川省立教育学院。1950年，四川省立教育学院师范、农学相关系科分别与1940年创办的国立女子师范学院、1946年创办的私立相辉文法学院等合并建立西南师范学院、西南农学院。
