区别如下：
1、出资人不同，自然人独资企业是自然人独自出资设立，法人独资公司是法人独自出资设立；
2、适用的法律不同，自然人独资适用《个人独资企业法》，法人独资适用《公司法》；
3、承责制度不同，自然人独资企业是无限连带责任，法人独资公司可以独立担民责。一个自然人只能设立一个独资企业。 一、自然人独资的特点有以下：
1、个人独资企业是由一个自然人投资的企业；
2、个人独资企业的财产为投资人个人所有；
3、个人独资企业的投资人以其个人财产对企业债务承担无限责任；
4、个人独资企业是一个人投资的经营实体。
二、自然人独资有限公司交税方法如下： 1、自然人独资有限公司一般需要交企业所得税，交税一般需要先进行工商注册，领取营业执照后去国地税报到；
2、专管员会根据企业的经营范围核定税种、给出网上申报密码，企业在国地税申报系统每月申报期内按时报税即可。 总之法人独资和自然人独资的区别在于出资人、适用的法律、承责制度不同，自然人独资为投资人个人所有，对企业债务承担无限责任，同时需要及时缴纳企业所得税。
