根据中国的税收制度，公司在进行跨省经营时，需要按照相关规定进行预缴税款。以下是一般的工程跨省预缴税流程：
1. 登记注册：首先，公司需要按照相关法律法规，在目标省份进行登记注册，并获取所需的工商营业执照和税务登记证。
2. 预缴税款初步核算：在进行工程跨省经营之前，公司需要进行预分配核算，计算出预计的应纳税额，并按照税法规定进行初步核算。
3. 税务申报：根据国家税务局的规定，公司需要按照规定的时间节点，使用电子税务局或纸质表格等方式，向税务部门进行税务申报。在申报过程中，公司需要提供一系列相关的财务数据和资料，如销售收入、成本、利润等。
4. 预缴税款：根据初步核算的应纳税额，公司需要在指定的时间内向税务部门进行预缴税款。具体的预缴税款金额和缴款方式根据税务部门的规定而定。
5. 审核及税款结算：税务部门将对公司的申报材料进行审核，并与公司核对相关数据。如有需要，税务部门可能会进行现场核查。核查无误后，税务部门会核定最终的应纳税额，并对预缴的税款进行结算，即退回多缴的部分，或要求补缴未缴的税款。
需要注意的是，不同地区对于工程跨省预缴税的具体规定可能略有不同，因此，公司在进行工程跨省经营前，最好咨询当地税务部门或专业税务咨询机构，了解具体的申报和缴纳流程，并及时遵守相关要求。
