一，磁盘分区容量区别，NTFS可以支持的分区(如果采用动态磁盘则称为卷)大小可以达到2TB（2048GB）,而Windows 2000中的FAT32支持分区的大小最大为32GB单
二，个文件容量区别，FAT32在实际运行中不支持单个文件大于4GB的文件，一旦超过容量限制那么系统就会提示磁盘空间不足。NTFS就目前来说已经突破了单个文件4GB的容量限制，目前来说似乎没容量限制，只要硬盘空间容量有多大，那么就NTFS就可以分到多大。
三安全方面区别，FAT32文件安全设置：不支持；NTFS文件安全设置：支持
FAT32和NTFS是两种不同的文件系统，它们在多个方面存在明显的区别。
首先，从支持分区大小来看，FAT32的最大磁盘分区只有32GB，这限制了其存储大型文件的能力，通常只适用于日常的文件传输。而NTFS则没有这样的限制，其分区大小可以达到2TB甚至更大，因此更适合存储大型文件，如许多现代应用程序和游戏。
其次，NTFS文件系统已经突破了单个文件4GB的容量限制，实际上已经没有明确的容量上限，只要硬盘有足够的空间，NTFS就可以支持。这使得NTFS非常适合存储大型程序和文件。
在安全性方面，NTFS文件系统提供了对文件夹和文件的加密、修改、运行、读取目录及写入权限的设置，这为用户提供了更高级别的数据保护。而FAT32文件系统则不支持这些高级别的安全设置。
此外，NTFS和FAT32在磁盘空间利用率、系统兼容性以及可用性等方面也存在差异。NTFS通常具有更高的磁盘空间利用率，更好的系统兼容性，以及更广泛的可用性。
综上所述，NTFS文件系统相较于FAT32文件系统，具有更大的分区支持、无单文件大小限制、更高级别的安全性以及更好的磁盘空间利用率等优点，因此更适合于大型文件和程序的存储以及需要高级数据保护的场景。然而，FAT32由于其简单性和广泛的兼容性，仍然在某些特定场合（如USB闪存驱动器等）得到应用。
