⒈ 分子式必须相同。
⒉ 相对分子质量相同、结构不同的化合物不一定是同分异构体。
如C2H4O和CO2；C2H4和CO；
C8H18和C17H14O等。
⒊ 结构不同。一是原子或原子团的连接顺序不同，二是原子的空间排列不同。
同分异构体互补性原则指的是DNA中A-T和C-G两种碱基之间的互补性。因为A和T之间形成两个氢键，C和G之间形成三个氢键，所以它们的结合是相对稳定的。
在DNA的复制、转录和翻译等过程中，通过遵循同分异构体互补性原则，DNA分子才能准确地复制自身，并将基因信息传递给后代细胞。同时，这种互补性还使得基因工程、PCR和DNA杂交等技术得以实现。因此，同分异构体互补性原则是生命科学中非常重要的基本原理之一。
