如果对方在支付令申请过程中提出异议，您可以采取以下措施：
1. 仔细阅读异议：仔细阅读对方提出的异议内容，了解其主张的事实和理由。这有助于您了解争议的焦点和可能的解决方案。
2. 准备证据：收集与争议事实相关的证据，如合同、协议、发票、邮件、短信、录音等。确保证据真实、合法、完整。
3. 咨询专业人士：如有需要，请咨询专业律师，了解在这种情况下的法律程序和应对策略。律师可以为您提供专业的法律意见和建议。
4. 申请法院审查：在收到异议后，您可以向法院提出支付令异议申请。法院将对异议进行审查，并根据审查结果作出相应的裁定。
5. 参加听证会：如果法院决定对异议进行听证，您需要参加听证会。在听证会上，您可以出示证据、说明事实和理由，以争取法院的支持。
6. 法院裁定：根据法院的裁定，支付令可能被撤销或变更。如支付令被撤销或变更，您可能需要重新提起诉讼或申请仲裁。
7. 重新提起诉讼或申请仲裁：如支付令被法院裁定撤销或变更，您可以根据法院裁定的结果，选择重新提起诉讼或申请仲裁，以解决纠纷。
请注意，处理支付令异议的具体程序和方法可能因地区和法律法规而有所不同。在处理异议时，请遵循相关法律法规和程序，如有疑问，请咨询专业律师。
债权人只能通过另行向法院起诉来维护自身的权益。
至此，关于通过支付令偿还债务的督促程序全部终结，债权人只能通过另行向法院起诉，来维护自身的权益。
