因为一般DNA分子中都有四种脱氧核苷酸，每种脱氧核苷酸有一种碱基，所以DNA分子中有四种碱基。
人体内共有20种氨基酸，四种碱基，如果是一个碱基对应一个密码子，能对应四种氨基酸，两个碱基就是16种，三个才是64足够对应所有氨基酸。
研究人员一直认为这是因为最初生命形成的原始环境中就只有这4种碱基。
首先，在大量的实验基础上发现编码DNA的碱基有四种，这是事实。
从DNA的双螺旋结构来讲，维持其稳定性的主要作用力有氢键，碱基堆积力，和盐键。其中氢键的形成需要碱基对之间的氨基和内酰胺氧形成，不能提供氨基（-NH2）只有胸腺嘧啶（仅在DNA中），所以AT之间三个氢键，GC之间两个氢键。也就是碱基配对原则，从这个方面看也能讲明 偶数 个碱基的重要性。
如果是两种碱基编码一个AA的话，2的三次方是8，恐怕不能编码出20种氨基酸。如果是三种或者三种以上编码一种氨基酸的话，就绰绰有余了。
