发光蘑菇大多生长在热带、亚热带光线比较暗的地区，因为体内含有会发光的物质，因此在暗处或黑夜中就发出淡蓝色、淡绿色或白色等不同颜色的荧光。
发光蘑菇不仅种类较多，分属于不同的科和属，其发光部位也不相同。大部分蘑菇的发光部位是菌盖，有的发光部位在菌柄，还有的发光部位在菌丝体上。
以最广为人知的是荧光小菇为例！荧光小菇又名荧光蕈、夜光茸。
荧光蕈的寿命通常只有3天，白天如果将荧光蕈移至暗处，并不发光，直到傍晚时分才会发出淡淡的绿光。如果混乱它的“作息时间”，白天也是可以发光的，这说明荧光蕈的发光时间有周期性。
小菇属中另一个在我国广为人知的发光物种是簇生孔小菇Mycena manipularis，子实体较小，菌盖直径1-3.5cm，半球形至扁半球形，表面湿润近似透明，幼时白色，后渐为污白色，往往表面可透视到管孔和条棱。菌肉污白，较薄。菌管孔状，长1.5-5mm，直生，蜡质，管口多角形，直径0.5-1mm。菌柄生中央，圆柱形，中空，长3-5cm，粗0.2-0.3cm，白色至污白色，质脆，表面有细粉末至光滑，此种据记载可食用。子实体在暗处或夜间发出淡绿色荧光，尤其菌柄发光更为显著，丛生或簇生于热带及亚热带阔叶林腐木上。
