“标本”主要指经脉腧穴分布部位的上下对应关系。“标”原意是树梢，引申为上部，与人体头面胸背的位置相应:“本”是树根，引申为下部，与人体四肢下端相应。 标本是相对概念，也是主次关系
①凡病因与症状，先病与后病，正气与邪气，病在内与病在外等，都有标本的关系。从人体与致病因素来说，人体的正气是本，致病的邪气是标；以疾病本身来说，病因是本，症状是标；从疾病的新病与旧病，原发与继发来说，旧病、原发病为本，新病、继发病为标；从疾病的部位来说，病在下、在内为本，病在上、在外为标。《素问·标本病传论》：“知标本者，万举万当；不知标本，是为妄行。”临证时需用标本关系分析病症的主次先后，轻重缓急，确定相应的治疗步骤。
②经络在四肢者为本，在头面、躯干者为标（见《灵枢·卫气》）。
③指病人的疾病与医生的治疗主次关系。《素问·汤液醪醴论》：“病为本，工为标，标本不得，邪气不服。”王冰注：“言医与病不相得也……此皆谓工病不相得，邪气不宾服也。岂惟针艾之有恶哉，药石亦有之矣。”标是指病理产物，本是指引起病理产物的部位的症状，比如咳嗽有痰，其中痰是咳嗽的产物，是标。咳嗽是发炎引起的，是本。光是祛痰就是治标，光是消炎就是治本，所谓标本兼治就是要既祛痰又要消除病灶部位的炎症。
