《萤火之森》改编自绿川幸在少女漫画杂志《LaLa》同名漫画，讲述了一个发生在乡村深山里的一个凄美的稍纵即逝的爱情故事。
竹川萤在妈妈的唠叨声中把萤送到乡下的外公家，在住满山神、妖怪的“山神之森”里，小萤独自在森林里游玩时，意外地闯进了栖息着妖怪的山神森林，在森林中迷了路。正当她因为恐惧而四处逃窜时，一个戴着狐狸面具的大男孩银出现在她面前，并引领着萤找到回家的路。萤由此对银产生了极大的兴趣，两人就此结下了奇妙的友谊。此后每一年，萤都会来到这片山林找银，但银的真实身份则是一旦被人类触碰就会消失的灵物。
在每一年的相处中，两人的羁绊也越来越深，他们共同玩耍、一起参加妖怪的祭祀仪式，在这过程中两人也对彼此产生了爱意。但银知道，两人无法触碰彼此，否则他就会永远地消失。最终在妖怪祭典上，银因为不小心触碰到人类而即将消失，在消失前银向萤敞开了怀抱，两人紧紧相拥。银在萤的怀中化为萤火，渐渐消失，只留下了一件狐狸面具。
