锦鲤的性别判断较为困难，但可以通过一些特征来分辨。
首先是分析鱼的体形，雄鱼体形稍大，背鳍和尾鳍尖端呈锐角，而雌鱼稍小，背鳍和尾鳍尖端呈圆弧形。
其次是观察颜色，雄鱼的鲜艳色彩更为明显，尤其是筋骨线条更为明显，而雌鱼的颜色较为柔和。
另外一种判断方法是观察鱼的生殖器官，雄鱼的生殖腺较大并且呈锥形，雌鱼的生殖腺较小且呈椭圆形。通过以上方法可以较为准确地分辨锦鲤的公母性别。
锦鲤的性别可以通过多种方式进行鉴别，以下是几种常用的方法：
体型：公鱼的身体比较瘦长，而母鱼的身体短粗而饱满，腹部比较大。
头型：公鱼的头部比较大且短，额头处会稍稍凸起。母鱼的头部比较小且长。
胸鳍：公鱼的胸鳍比较粗壮强硬，呈现出尖尖的形状。而母鱼的胸鳍比较大，呈现出椭圆形。另外，公鱼在繁殖期的时候会出现追星情况（在胸鳍和鳃部的第一鳍条部分有颗粒装凸起），繁殖期过后，追星就会消失。
腹部：公鱼的腹部比较坚硬且呈现出宽平的形状，母鱼的腹部比较柔软且丰满。可以用手接触一下进行分辨。
生殖孔：公鱼的生殖孔呈现凹陷状，如果用手挤压，公鱼就会流出来乳白色的精液。母鱼的生殖孔呈现出凸起状，用手挤压只会排出粪便。
产卵动作：在进入繁殖期产卵时，母鱼会不停的游动吸引公鱼的注意。公鱼状态较平常相比会显得比较的亢奋，也会有意的亲近母鱼。这点是比较好观察的。
生长速度：同窝鱼中，生长快的是公鱼，慢的是母鱼。
以上是鉴别锦鲤性别的一些常用方法，但需要注意的是，由于锦鲤品种繁多，不同品种的锦鲤在性别的鉴别上可能存在一定的差异。因此在实际操作中，需要结合多种方法进行鉴别，同时也要注意积累经验，提高鉴别准确率。
