蓝绿藻是一种介于细菌与藻类之间的原核微生物，过去被归类为藻类，但有人主张应改归类为细菌才适当，因为它与属于真核微生物的藻类为并不相同，具有细菌的某些特征，所以也可以称为篮细菌，能进行细胞分裂生殖，繁殖速度相当快。可视为属于一种尚未完全由细菌演化为真正藻类的过度生物，不同于一般细菌的是，它的细胞中含有叶绿素，因此能进行光合作用，自营生活。
丝状藻通常属于绿藻种类，因藻体呈丝状而得名，品种很多且形态相似，有时候用肉眼不容易辨识。主要附着生长在水草叶片及石头上，以绿色品种居多，外形多半为棉花状、线状、或刷状。它们的生长条件与水草几乎相同，很容易在水草缸生长，可称得上是水草缸的常客。
黑毛藻
黑毛藻是鱼友最不想看见的一种藻类。既不好清理，有很难看。一般长在石头的边缘、叶子的边缘。黑毛藻是在视觉效果中最难看的一种藻。爆发之后就像缸里东西发霉了一样。鱼缸里缺少二氧化碳，水流太强或者pH值过高都会引发黑毛藻。并且这个东西无法物理清除，它长得分散，还很细，一根一根的，也不会长在光滑的平面上。也很好有鱼儿愿意吃它，一般鱼友会用黑线飞狐来抑制黑毛藻。也有鱼友会下戊二醛来治疗黑毛藻。、
绿毛藻
绿毛藻的体型呈丝状，很柔软，经常会附着到水草上或石头上。一般几毫米长，毛茸茸的。绿毛藻对光照要求较高，需要光照。水里有机物过多，水体富营养化，氨氮含量过高都会给它提供充足的养分。要想缓解绿毛藻的话，可以通过换水了来稀释鱼缸的水体富营养化。藻类在鱼缸是和植物扮演的是同样的角色，因为会和植物来争夺养分。促进植物的吸收藻类就会被压制。也可以直接用物理方法来直接清除掉。也可以用一些大和虾啃食。
