从外形特征看，鳖吻突较长，约等于眼径，颈基两侧无大的瘰疣，背甲前缘无明显疣粒。鼋吻突极短，不到眼径一半，头大、颈长，背盘近圆形。
从体型、体色看，鳖扁平，体重较轻，背甲暗绿色，光滑，中后部有散生小疣粒，数量较少。鼋体型大，体重可达100公斤，背部呈黄褐色，并有褐色斑纹，背部有散生小疣粒，数量多。
鼋与甲鱼外形不同，吻突极短，鼋只在夜间活动，现在几乎灭绝。
一、外形不同
甲鱼其头像龟，但背甲没有乌龟般的条纹，边缘有软状裙边，壳要比乌龟的软。颜色墨绿。外形呈椭圆形，比龟更扁平，它的背腹甲上着生柔软的外膜，周围是细腻的裙边，头颈和四肢可以伸缩，肢各生五爪，爬行敏捷，从外形颜色观察，甲鱼通常背脊和四肢呈暗绿色，有的背面浅褐色，腹面白里透红。鼋吻突极短，不到眼径的一半；尾端超出裙边。体长600毫米左右。头部相当小；吻突圆而短，不到眼径的1/2；鼻孔位于吻端；眼小；头背宽平而光滑。头部光滑，颈部无疣；背部覆盖疣粒；脊板和肋板凸回不平。体背橄榄色，上有黄白色的点斑；腹面白色。
二、呼吸系统不同
甲鱼生长期间主要以肺呼吸，当水温低于15℃时，甲鱼就潜入池底淤泥开始冬眠，靠喉咙部的鳃状组织等辅助呼吸器官进行呼吸。
鼋最大的本能是，不仅能用肺呼吸，而且能用皮肤呼吸；甚至能通过咽喉吸取氧气，在水中长时间生活。白天隐于水中，常浮出水面呼吸，夜间在浅滩处觅食。
三、保护级别不同
甲鱼是一种珍贵的经济动物，不仅肉味鲜美，营养丰富，蛋白质含量高，被视为名贵的滋补品。
