基德化妆为白鸟警官，偷听到了柯南和博士的电话，通过电话内容得知了柯南就是工藤新一。《名侦探柯南》第219集《新一VS怪盗基德》中，介绍了基德与在变小之前的新一的一次较量（他们并没有真正碰面，新一甚至不知道小偷的名字），而大背景正是在第76集《柯南VS怪盗基德》里，准备偷铃木财团暗夜星辰的基德回忆的往事。
由此可见，在第76集里柯南虽是第一次见到基德，而基德已经感觉到柯南似乎就是从前那个给他添麻烦的侦探，所以要说基德知道柯南身份最早是就在第76集，但具体说明如何知道的就是在第 219集里。
在剧场版《名侦探柯南：世纪末的魔术师》中则说明了基德发现柯南身份的原因，基德通过窃听知道了江户川中柯南的真实身份，在剧场版《世纪末的魔术师》中，化妆为白鸟警官的基德偷听了柯南和阿笠博士的电话内容，从而知道他就是新一，而后更是化妆成新一替柯南解围，瞒过了产生怀疑的毛利兰。这一事件其实就是交代了基德已经知道柯南的身份就是工藤新一，并且他还知道这个侦探为了某个原因有意隐瞒自己的身份。
