史料显示，在这里曾有两个教堂，一个是圣坦尼大教堂，另一个是圣母玛丽亚教堂。圣坦尼大教堂早在10世纪时，就已经成为巴黎、或整个法国的宗教中心。但是，也正因为这样的重要性，人们开始发现原有的圣史蒂芬教堂与其所承担的重任不相符，再加上原本的教堂已经随着时间而老旧，而开始思索重新修筑教堂。
现在的巴黎圣母院始建于1163年，在1345年建成。
圣母院的前身是一座古老的罗马式的建筑，1163年，法国国王路易九世把它拆除，在原址上建成了巴黎圣母院。从1163年至1345年，巴黎圣母院建筑发生了多次变化，最终形成了现在的外观，以及具有极高艺术价值的内部装饰。
改革时期，巴黎圣母院受到了法国文化大革命的重创，大量的艺术品被毁损。1845年，由于巴黎圣母院的历史和艺术价值，法国政府正式把它列为历史古迹，并由法国政府保护。近年来，巴黎圣母院的改建工程已经开始，经过几年的努力，巴黎圣母院已经重新焕发出它历史的神秘与魅力，令更多的人深深着迷。
