个体营业执照正本丢失的注销流程如下： 1、个体营业执照正本丢失的注销，需要先办理丢失手续，取得营业执照正本，然后才可以办理注销手续；营业执照遗失或毁损的，个体工商户应当向登记机关申请补领或者更换。营业执照遗失的，个体工商户还应当在公开发行的报刊上声明作废。申请个体工商户注销登记，应当提交下列文件：
（1）申请人签署的个体工商户注销登记申请书；
（2）个体工商户营业执照正本及所有副本；
（3）国家工商行政管理总局规定提交的其他文件。
2、携带开户的所有资料，先将公司银行账户中的钱全部转走，进行银行销户，须携带开户的所有资料，包括营业执照正副本，税务登记证正副本，银行开户许可证，机构信用代码证，法人身份证和经办人身份证原件及复印件，公章，财务专用章，名章。
3、如果有未开具的空白发票，先在开票系统中将未开具的空白发票进行作废； 4、带着发票领购簿和未开具的空白发票到税务局进行验票，没有问题后，税务局会收回发票领购簿并告知回去对金税盘进行修改时钟，并进行抄当月税，具体的流程可以咨询当地的金税盘服务企业。
5、金税盘修改好时钟，完成抄税，携带金税盘，税务登记证正副本，公章，对金税盘和税务登记进行注销，税务局受理后3-5个工作日会出具税务事项通知书予以核准注销。
6、携带营业执照正副本、和税务局出具税务事项通知书原件及复印件、公章到工商局注销营业执照；
7、个体户成功注销掉营业执照。
