主题教育全覆盖的主要做法包括:制定全面、具体的实施方案;加强组织领导和统筹协调;深入基层开展调研、宣传和培训;积极探索创新方式方法;强化考核评估和督促落实等。通过以上综合措施,确保主题教育全面覆盖、全方位推进,取得实实在在的成效。