红豆杉的花朵单生于叶腋，雄花有花梗，雌花基本没有花梗支撑。成熟时为肉质杯状的红色假种皮。花朵初开白色，后为黄色。红豆杉的花朵主要用于观赏，树干则是用于木材加工制造。花语含义中有着高雅傲气，以及相思、思念等象征意义。
红豆杉的花长得非常小，母花和雄花常常生长在同一颗树上，雄花的花序多长在母花的下端，花序6-12花，花序轴坚硬上弯或重直且有黑色间隙；花苞底部环状萼片短，心形，雄花有四片花瓣，花瓣远离萼片；母花有六片花被片，合生，花被举目有针对叶形，无毛，侧裂片光滑，疏松，中间位置为浅黄绿色，每片花被丛生开有黄色或黄绿色的花药头；果实长约1.5厘米，先端微收缩成钩形。
红豆杉的花形态非常独特，可以说是美丽而神秘的。
