回答如下：有许多原因可能导致克隆系统分区后不能启动，以下是一些可能的原因和解决方法：
1. 硬件兼容性问题：如果你将系统安装在一台计算机上，然后将硬盘克隆到另一台计算机上，可能会出现硬件兼容性问题。尝试在新计算机上重新安装操作系统。
2. 引导分区问题：如果你没有正确设置引导分区，系统可能无法启动。确保引导分区正确设置，并使用引导修复工具来修复引导问题。
3. 磁盘分区问题：如果你将系统克隆到一个大小不同的硬盘上，可能会出现分区问题。使用磁盘管理工具来调整分区大小。
4. 磁盘格式问题：如果你将系统从一个NTFS格式的硬盘上克隆到一个FAT32格式的硬盘上，可能会出现问题。确保新硬盘格式与原硬盘格式相同。
5. 病毒感染问题：如果你的原硬盘存在病毒感染，克隆到新硬盘上后也可能会受到影响。使用杀毒软件扫描克隆硬盘。
6. 克隆软件问题：如果你使用的克隆软件不稳定或不兼容，可能会导致克隆失败。使用稳定和可靠的克隆软件。
总之，如果你的系统分区克隆后不能启动，需要仔细检查硬盘兼容性、分区设置、引导问题、病毒感染等问题，并尝试使用相应的工具和方法来解决问题。
在克隆系统的时候破坏掉引导文件过丢失是不能启动的，最好用ghost做系统备份
