为提高酥瓜的出芽率，在催芽前最好对其进行去杂去劣，筛选出优质酥瓜种子。
为减少病毒对酥瓜后期生长的影响，可在其种植前使用500～600倍的多菌灵或甲基托布津对其种子浸泡15min进行灭菌处理，然后及时捞出并使用清水进行清洗，然后置于15%的磷酸三钠中浸泡30min对病毒进行钝化，最后将种子使用清水进行清洗，并置于50～60℃的温水中浸泡并不断搅拌至温度降至30℃，并在30℃的温水中浸泡6～8h。
浸泡结束后将种子捞出，并使用干净的粗布将种子分层包好，并撒入适量的水分，然后置于30～32℃的恒温条件下进行催芽，一般在24～30h就可以出现胚根，带80%的种子出现胚根即可进行播种。
