日本神话的话语系统以及组织形式受中国和印度的影响很深，这与中国的儒教与印度的佛教传入有关，另外，统治阶级选择将中国的道教思想及印度的佛教融会进日本的神话中是出于政治利益考虑的。
公元五世纪后，佛教传入日本，一部分皈依佛教的大臣与坚守传统神道的大臣以各自的信仰为幌子作权利的争斗。
日本神话中最初的神代表自然，他们是抽象的、无性别的独神，第二代神同样代表自然，但属具象的，如泥沼等，并且大部分拥有性别。对于世界的创造，日本神话的描述比较独特，在其他国家的神话中，世界通常是由一男性神创造的，而在日本神话中，世界由男性神伊耶那岐神与女性神伊耶那美神共同创造（岐、美是对男女的美称）。
