根据国家税务总局的规定，农村经济合作社在进行税务登记时，应该根据经营的实际情况选择相应的国标行业类型。根据《国民经济行业分类》（GB/T 4754-2017）的规定，农村经济合作社可以选择以下行业类型：
1. 农、林、牧、渔业
2. 工业
3. 建筑业
4. 批发和零售业
5. 交通运输、仓储和邮政业
6. 住宿和餐饮业
7. 信息传输、软件和信息技术服务业
8. 房地产业
9. 租赁和商务服务业
10. 科学研究和技术服务业
11. 水利、环境和公共设施管理业
12. 文化、体育和娱乐业
13. 综合类
需要根据农村经济合作社的具体经营情况，选择最符合实际情况的国标行业类型进行税务登记。如果不确定如何选择，可以咨询当地的税务部门或会计师事务所的专业人士。
