1.学历性质不同：专接本属于全日制普通本科教育，为第一学历；自考为第二学历。
2.就读年限不同：专接本的就读年限为两年，部分医学类专业三年。自考，没有固定的就读年限。
3.学习方式不同：专接本为全日制脱产就读；自考为自学，教育部门只负责组织考试来检验考生的学习效果。
专接本与自考的区别主要体现在：1）报考时要求的学历不同：专接本报考需要有专科学历，并且是在专科学习的最后一年报考的，如果上的是两年制大专，则大二考。若是三年制的大专，则是大三考。而自考报名对学历是无限制的。2）入学条件不同：专接本需要参加入学考试，考试合格后才能进入本科阶段学习；而自考没有入学考试，只需报名即可。3）学历性质不同：专接本取得的是普通高等教育的本科，也就是统招全日制本科，而自考取得的是成人高等教育的学历。4）证书含金量不同：专接本的学历证书含金量要高于自考学历证书。专接本的学历属于第一学历，而自考的学历属于第二学历。
