1、密封法。
无论放在袋中或密封罐中，都要记得将袋口或罐口密封好，以免受潮。
2、阴凉干燥。
光线、湿气与温度都容易让莲子芯变质，因此，要放置在干燥阴凉处。
3、急冻法
量少时可以采用急冻法，放在冰箱冷藏室保存即可，可以让莲子不生虫。
4、花椒法
如果买的莲子较多的话，可以用到花椒来保存。由于花椒的特殊气味使它可以有效地防止莲子生虫；可以将花椒撒于莲子中，搅拌一下。放在阴凉干燥处即可，要食用时只需用水浸泡几分钟，花椒和莲子即可分层。
莲子的外壳剥去，然后放在太阳底下晒干，可以分开多次晾晒，直到水分完全蒸发之后，就可以进行保存了，但是在保存的时候一定要注意容易的密封性，这样可以保证莲子长期保存不腐坏。
如果还想延长莲子的保存期限的话，还可以将晒干后的干莲子放在冰箱中冷藏，这样可以抑制细菌增长。
